Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH72

Trim32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim32Q8CH72 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim32Q8CH72 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim32Q8CH72 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim32Q8CH72 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim32Q8CH72 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim32Q8CH72 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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