Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm28Q8CGC6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rbm28Q8CGC6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms