Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Rdh13Q8CEE7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Rdh13Q8CEE7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Rdh13Q8CEE7 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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Rdh13Q8CEE7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Rdh13Q8CEE7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Rdh13Q8CEE7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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Rdh13Q8CEE7 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rdh13Q8CEE7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rdh13Q8CEE7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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