Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

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Length 847 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Ttc27Q8CD92 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc27Q8CD92 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ttc27Q8CD92 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms