Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E4f1Q8CCE9 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E4f1Q8CCE9 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
E4f1Q8CCE9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E4f1Q8CCE9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E4f1Q8CCE9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E4f1Q8CCE9 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
E4f1Q8CCE9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
E4f1Q8CCE9 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms