Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC35

Synpo, Synaptopodin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 929 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynpoQ8CC35 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SynpoQ8CC35 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SynpoQ8CC35 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms