Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Atg4aQ8C9S8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atg4aQ8C9S8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms