Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bhlhe22Q8C6A8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bhlhe22Q8C6A8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bhlhe22Q8C6A8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bhlhe22Q8C6A8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bhlhe22Q8C6A8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bhlhe22Q8C6A8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bhlhe22Q8C6A8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bhlhe22Q8C6A8 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bhlhe22Q8C6A8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Bhlhe22Q8C6A8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Bhlhe22Q8C6A8 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms