Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ssuh2Q8C3L1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Pbld1-201ENSMUST00000020266 2407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ssuh2Q8C3L1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
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