Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Znf428Q8C1M2 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms