Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Atg16l1Q8C0J2 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Atg16l1Q8C0J2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Atg16l1Q8C0J2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Atg16l1Q8C0J2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Atg16l1Q8C0J2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Atg16l1Q8C0J2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Atg16l1Q8C0J2 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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