Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Ctdsp2Q8BX07 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Ctdsp2Q8BX07 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Ctdsp2Q8BX07 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Ctdsp2Q8BX07 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Ctdsp2Q8BX07 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
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