Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Zfp398Q8BV16 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Zfp398Q8BV16 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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