Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ33

Ticrr, Treslin, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TicrrQ8BQ33 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TicrrQ8BQ33 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TicrrQ8BQ33 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TicrrQ8BQ33 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TicrrQ8BQ33 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TicrrQ8BQ33 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TicrrQ8BQ33 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TicrrQ8BQ33 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TicrrQ8BQ33 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TicrrQ8BQ33 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TicrrQ8BQ33 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TicrrQ8BQ33 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TicrrQ8BQ33 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TicrrQ8BQ33 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TicrrQ8BQ33 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TicrrQ8BQ33 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TicrrQ8BQ33 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TicrrQ8BQ33 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TicrrQ8BQ33 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TicrrQ8BQ33 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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TicrrQ8BQ33 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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TicrrQ8BQ33 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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TicrrQ8BQ33 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.06■□□□□ 0
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TicrrQ8BQ33 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TicrrQ8BQ33 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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