Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lrsam1Q80ZI6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Lrsam1Q80ZI6 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Lrsam1Q80ZI6 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lrsam1Q80ZI6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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