Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ttc28Q80XJ3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ttc28Q80XJ3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms