Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp8Q80U87 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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