Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Avl9Q80U56 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Avl9Q80U56 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Avl9Q80U56 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Avl9Q80U56 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Avl9Q80U56 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Avl9Q80U56 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Avl9Q80U56 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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