Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sgo2Q7TSY8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms