Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dsg1cQ7TSF0 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dsg1cQ7TSF0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms