Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc88cQ6VGS5 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc88cQ6VGS5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc88cQ6VGS5 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ccdc88cQ6VGS5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccdc88cQ6VGS5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ccdc88cQ6VGS5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ccdc88cQ6VGS5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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