Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Zbtb40Q6PCS8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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Zbtb40Q6PCS8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Zbtb40Q6PCS8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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