Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Smchd1Q6P5D8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Smchd1Q6P5D8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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