Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
NipblQ6KCD5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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