Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Tpm4Q6IRU2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Tpm4Q6IRU2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Tpm4Q6IRU2 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Tpm4Q6IRU2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Tpm4Q6IRU2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Tpm4Q6IRU2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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