Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf8Q6DID3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms