Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

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Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pram1Q6BCL1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pram1Q6BCL1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms