Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrcc1Q69ZB0 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms