Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CltcQ68FD5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CltcQ68FD5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms