Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ino80dQ66JY2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ino80dQ66JY2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms