Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifit1Q64282 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ifit1Q64282 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms