Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phox2aQ62066 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phox2aQ62066 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phox2aQ62066 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phox2aQ62066 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phox2aQ62066 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phox2aQ62066 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phox2aQ62066 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phox2aQ62066 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phox2aQ62066 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phox2aQ62066 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phox2aQ62066 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Phox2aQ62066 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Phox2aQ62066 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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