Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cnot7Q60809 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Cnot7Q60809 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Cnot7Q60809 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Cnot7Q60809 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Cnot7Q60809 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Cnot7Q60809 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Cnot7Q60809 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cnot7Q60809 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms