Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prdm1Q60636 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Prdm1Q60636 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms