Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Nr2f1Q60632 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Nr2f1Q60632 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms