Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a3Q5XF89 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a3Q5XF89 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a3Q5XF89 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a3Q5XF89 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atp13a3Q5XF89 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atp13a3Q5XF89 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms