Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Fam208bQ5DTT3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Fam208bQ5DTT3 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms