Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

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Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Znf608Q56A10 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf608Q56A10 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Znf608Q56A10 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Znf608Q56A10 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Znf608Q56A10 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf608Q56A10 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Znf608Q56A10 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Znf608Q56A10 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf608Q56A10 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf608Q56A10 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Znf608Q56A10 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Znf608Q56A10 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf608Q56A10 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Znf608Q56A10 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf608Q56A10 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Znf608Q56A10 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf608Q56A10 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf608Q56A10 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf608Q56A10 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Znf608Q56A10 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf608Q56A10 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
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Znf608Q56A10 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Znf608Q56A10 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf608Q56A10 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Znf608Q56A10 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Znf608Q56A10 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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Znf608Q56A10 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf608Q56A10 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Znf608Q56A10 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Znf608Q56A10 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf608Q56A10 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf608Q56A10 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf608Q56A10 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf608Q56A10 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf608Q56A10 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf608Q56A10 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Znf608Q56A10 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Znf608Q56A10 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf608Q56A10 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf608Q56A10 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf608Q56A10 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf608Q56A10 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf608Q56A10 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Znf608Q56A10 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Znf608Q56A10 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Znf608Q56A10 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Znf608Q56A10 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Znf608Q56A10 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Znf608Q56A10 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms