Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H1

Ckap2, Cytoskeleton-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2Q3V1H1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ckap2Q3V1H1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ckap2Q3V1H1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms