Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Pfdn4Q3UWL8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Pfdn4Q3UWL8 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Pfdn4Q3UWL8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pfdn4Q3UWL8 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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