Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Hdgfl2Q3UMU9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Hdgfl2Q3UMU9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Hdgfl2Q3UMU9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Hdgfl2Q3UMU9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Hdgfl2Q3UMU9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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