Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Sf3b2Q3UJB0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Sf3b2Q3UJB0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms