Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx27Q3UHD6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms