Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
LbrQ3U9G9 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
LbrQ3U9G9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms