Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Q3U6N9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Q3U6N9 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Q3U6N9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U6N9 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U6N9 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Q3U6N9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Q3U6N9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Q3U6N9 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Q3U6N9 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Q3U6N9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Q3U6N9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Q3U6N9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Q3U6N9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Q3U6N9 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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