Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Otud5Q3U2S4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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Otud5Q3U2S4 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Otud5Q3U2S4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Otud5Q3U2S4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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