Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Palb2Q3U0P1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Palb2Q3U0P1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms