Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

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Length 965 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tbc1d2bQ3U0J8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tbc1d2bQ3U0J8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tbc1d2bQ3U0J8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Tbc1d2bQ3U0J8 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tbc1d2bQ3U0J8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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