Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pdlim7Q3TJD7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pdlim7Q3TJD7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms