Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trappc13Q3TIR1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc13Q3TIR1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms